Il pesto al basilico fresco può essere congelato per fare scorta. L'ideale è suddividerlo in piccole porzioni in vasetti di vetro con tappo a vite, contenitori per uova, contenitori per cubetti di ghiaccio o pirottini per muffin. Poiché il pesto non dovrebbe essere riscaldato, è importante prestare molta attenzione alla pulizia e utilizzare solo utensili ben puliti. Una volta congelate le singole porzioni, trasferirle in sacchetti per freezer. Indicare la data di congelamento sui vasetti, sui contenitori o sui sacchetti. Il pesto si conserva in freezer per circa tre mesi. Prima dell'uso, lasciare scongelare le porzioni necessarie in frigorifero o a temperatura ambiente.